第三代試管助孕對女性傷害不大，基本上沒有后遺癥。因為在試管輔助懷孕的過程中，醫生會根據女性的身體狀況制定專屬的治療方案，對藥物的用量非常謹慎，幾乎沒有副作用，對女性朋友的傷害很小。但是，如果女性選擇的試管醫院不正規，或者在試管治療過程中沒有按照醫生的要求服藥，可能會對身體造成嚴重傷害，如卵巢刺激、卵巢早衰等，嚴重影響自身生命安全。因此，建議患者在選擇試管醫院時，一定要去正規合格的醫院，在試管期間積極配合醫生，這樣才能盡快懷孕。
第三代大多數女性來說，第三代試管受精技術在極少數情況下可能會出現危及生命的并發癥或并發癥。治療前，醫生會根據患者的身高、體重和以往對藥物治療的反應，靈活制定促排卵方案，減少嚴重過度刺激反應的概率。但有些患者在試管過程中仍可能受到一些身體傷害，具體如下：
1、腹痛、腹水等輕微癥狀
如果試管取卵手術不當，很可能引起孕婦腹痛，腹部有一定的水，導致呼吸道壓迫和呼吸窘迫，嚴重時可能出現血栓形成。
2、引起多胎、妊娠并發癥
試管的成功率相對較低。為了提高成功率，許多醫生在移植過程中移植了一到三個胚胎。如果它們都存活下來，就會有多胎妊娠，很容易導致其他孕婦只有在高危時期才會出現妊娠并發癥。容易流產、早產、胎盤早剝，對孕婦危害很大。
3、卵巢過度刺激
卵巢過度刺激是指使用大劑量排卵藥物促進多個卵泡的發育，有些人可能出現卵巢過度刺激，導致胸積液、腹水、肝腎功能障礙、血栓形成等風險，這種情況可能需要輸液治療、住院治療，甚至有些人可能有生命危險。
4、患卵巢癌的風險
高劑量的排卵藥物可能會增加患卵巢癌的風險，但沒有足夠的證據支持這種風險的相關性，但由于體外受精技術只發展了幾十年，需要長期觀察這種排卵藥物與女性腫瘤的關系。
